Das Jugendzentrum z6 entsteht ursprünglich als Gegenpol zum bürgerlichen Mittelschule- Jugendzentrum der MK (Marianische Kongregation) in der Sillgasse. Der Name z6 leitet sich von der Zollerstraße 6 ab, wo das erste Jugendzentrum beheimatet ist. Im Dezember 1971 gelingt es, in den ehemaligen Räumlichkeiten des Jugendheims Wilten-West, das damals noch kirchliche z6 zu etablieren. Auf insgesamt drei Stockwerken samt Keller entsteht ein Anlaufort für Jugendliche aus dem Arbeiter*innenmilieu. In dieser Tradition kann das z6 bis in die Gegenwart gesehen werden. Denn das z6 wird hauptsächlich von Jugendlichen genutzt, die von gesellschaftlicher Stigmatisierung und Diskriminierung betroffen sind, die armutsgefährdet sind und denen Anschlüsse und Teilhabe an gesellschaftlichen Strukturen erschwert sind.

Ab den 1990er Jahren entdeckt eine neue Gruppe von Jugendlichen das z6. Ihre Eltern sind als Gastarbeiter*innen nach Österreich gekommen. Die erste Generation migrantisierter Jugendliche ist im z6 angekommen. Ab den 2000-er Jahren, aber besonders ab 2015, erreicht das Jugendzentrum Jugendliche, die selbst oder deren Eltern nach Europa flüchten mussten.

Aus den rassistischen Erfahrungen der Jugendlichen ergeben sich für die pädagogische und politische Arbeit neue Themen. Gemeinsam mit den Jugendlichen bearbeitet das z6 die rassistischen Verhältnisse und versucht, sie aktiv zu empowern und Handlungsmöglichkeiten wie Strategien zur Teilhabe zu erarbeiten, in Form von Beratung und psychosozialer Begleitung, aber vor allem in Gestalt jugendkultureller Aktivitäten und der Schaffung eigener Erfahrungsräume. Sind die Ausdrucksformen in den 1990er- Jahren Street- und Breakdance, kommen in den frühen 2000er Jahren weitere Elemente aus dem Hip-Hop wie Rap, Jamsession oder Graffiti hinzu, mittels derer die Jugendarbeit Anschlüsse an die Jugendszenen findet. Über freizeitpädagogische Angebote und gemeinsame Erlebnisse in der Natur wie über das Projekt "Walk About", mittels niederschwelligste Kunstförderung für Jugendliche über die z6 Kulturproduktionen oder die aktive Raumaneignung für Anliegen Jugendlicher - wie dem jährlichen z6 Straßenfest oder dem Bauwagen, früher im Stadtteil Hötting-West und heute im Campagne-Areal -  erlangen Jugendliche Selbstwirksamkeit und Selbstbewusstsein. Raumaneignung, wie zum Beispiel ab 2013 im Jugendcafé Marha.Bar, kann dabei als gelebtes Empowerment verstanden werden: sich bestärken, gemeinsam Kochen, Deutschkurse organisieren, ein Tonstudio betreiben, Jamsession organisieren und vieles mehr. Das Jugendcafé Mahar.Bar steht in der Tradition von bereits früheren z6 Cafés, wie dem Café Pausenlos oder dem autonomen Café Sub, welches bis in die 2000er Jahre Bestand hatte.

Die politische Arbeit geht im z6 immer Hand in Hand mit der pädagogischen. Zusammen mit den Jugendlichen werden Demonstrationen gegen Abschiebung und Rassismus organisiert, Transparente gestaltet, wird ein Jugendparlament eingerichtet, werden Erfahrungen sichtbar gemacht und dagegengehandelt. Zentral ist dabei, dass Jugendliche sich selbst vertreten. 1995 beispielsweise kommt es bei einer Podiumsdiskussion im z6 zu einer persönlichen Auseinandersetzung zwischen Jugendlichen des z6 und den damaligen Innenminister Caspar Einem: Das Thema ist die rassistische Fremden- und Abschiebepolitik Österreichs.

Das Jugendzentrum wird in den 1980er Jahren um eine Familien- und Drogenberatung erweitert, in den 1990er-Jahre entwickelt sich das Streetwork z6 als eigenständige Einrichtung des Vereins. 2010 wird das Jugendzentrum in Zentrum für Jugendarbeit z6 umbenannt. 2014 wird mit der nunmehr eigenständigen Drogenarbeit z6 der dritte Bereich des z6 geschaffen.